Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 SVF1YDR346C 1446 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ARN2YHL047C 1863 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 FPK1YNR047W 2682 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YEL028WYEL028W 462 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YER010CYER010C 705 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YER134CYER134C 537 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 UIP3YAR027W 708 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 SMP1YBR182C 1359 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 IBA57YJR122W 1494 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 DAK1YML070W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ELP2YGR200C 2367 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 BAP2YBR068C 1830 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 RTN1YDR233C 888 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MRF1YGL143C 1242 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ZRT2YLR130C 1269 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 AFT1YGL071W 2073 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 UBP9YER098W 2265 nt5.49□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 SKS1YPL026C 1509 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 IFM1YOL023W 2031 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PDI1YCL043C 1569 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YHR177WYHR177W 1362 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PRP46YPL151C 1356 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 CDC43YGL155W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MTW1YAL034W-A 870 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YKR075CYKR075C 924 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PAU17YLL025W 375 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YNL019CYNL019C 855 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YNL033WYNL033W 855 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 snR10snR10 245 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 UBC11YOR339C 471 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 RMI1YPL024W 726 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MRL1YPR079W 1146 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 HES1YOR237W 1305 nt5.48□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 DAL81YIR023W 2913 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PRI2YKL045W 1587 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MCM4YPR019W 2802 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 CAD1YDR423C 1230 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PIC2YER053C 903 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YJL107CYJL107C 1164 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 MOG1YJR074W 657 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YLL017WYLL017W 312 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 HCR1YLR192C 798 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 PPA2YMR267W 933 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ARG8YOL140W 1272 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 YPL102CYPL102C 303 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 ARR1YPR199C 885 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 UTP18YJL069C 1785 nt5.47□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 SYG1YIL047C 2709 nt5.46□□□□□ -1.53
YKU80Q04437 GCS1YDL226C 1059 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 RML2YEL050C 1182 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 RPT6YGL048C 1218 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 RAI1YGL246C 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 DBP8YHR169W 1296 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 BUB3YOR026W 1026 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YPL062WYPL062W 405 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 ECM33YBR078W 1290 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 MRPS5YBR251W 924 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 PCL10YGL134W 1302 nt5.46□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 PCL8YPL219W 1479 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YHR182WYHR182W 2358 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 GLE2YER107C 1098 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 NOP13YNL175C 1212 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 PPG1YNR032W 1107 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 NAT5YOR253W 531 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 snR3snR3 194 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 SMF3YLR034C 1422 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 TUP1YCR084C 2142 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 STL1YDR536W 1710 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 ADE12YNL220W 1302 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 NFI1YOR156C 2181 nt5.45□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 INO2YDR123C 915 nt5.44□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YNL143CYNL143C 393 nt5.44□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 TIP20YGL145W 2106 nt5.44□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 ATH1YPR026W 3636 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 NGR1YBR212W 2019 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 PRE3YJL001W 648 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 APS3YJL024C 585 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 NTR2YKR022C 969 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YBR144CYBR144C 315 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 SNF3YDL194W 2655 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 LYS21YDL131W 1323 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 PAL1YDR348C 1500 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 VPS36YLR417W 1701 nt5.43□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 ACC1YNR016C 6702 nt5.42□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 OMS1YDR316W 1416 nt5.42□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.42□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 CSR1YLR380W 1227 nt5.42□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 FOL1YNL256W 2475 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YGR122WYGR122W 1209 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 MND2YIR025W 1107 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 TAF4YMR005W 1167 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 RPS15YOL040C 429 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YOR289WYOR289W 756 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 SMA1YPL027W 738 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 APM2YHL019C 1818 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 TPS3YMR261C 3165 nt5.41□□□□□ -1.54
YKU80Q04437 YDR445CYDR445C 408 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms