Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX5Q02548 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms