Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEX3Q00994 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BEX3Q00994 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms