Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK16Q00536 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms