Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2LP62875 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2LP62875 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms