Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS2P61201 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS2P61201 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS2P61201 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS2P61201 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS2P61201 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS2P61201 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS2P61201 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS2P61201 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS2P61201 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS2P61201 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS2P61201 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS2P61201 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS2P61201 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPS2P61201 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPS2P61201 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS2P61201 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS2P61201 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS2P61201 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms