Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN1P60606 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms