Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2E1P51965 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2E1P51965 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2E1P51965 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms