Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2D1P51668 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms