Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF6P49848 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF6P49848 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF6P49848 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF6P49848 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF6P49848 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF6P49848 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF6P49848 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF6P49848 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF6P49848 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF6P49848 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF6P49848 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF6P49848 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF6P49848 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF6P49848 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF6P49848 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF6P49848 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF6P49848 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms