Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP153P49790 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP153P49790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP153P49790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP153P49790 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP153P49790 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP153P49790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP153P49790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NUP153P49790 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NUP153P49790 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NUP153P49790 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NUP153P49790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NUP153P49790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NUP153P49790 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
NUP153P49790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NUP153P49790 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NUP153P49790 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP153P49790 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP153P49790 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP153P49790 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP153P49790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP153P49790 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NUP153P49790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NUP153P49790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NUP153P49790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NUP153P49790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NUP153P49790 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NUP153P49790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NUP153P49790 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NUP153P49790 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NUP153P49790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NUP153P49790 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NUP153P49790 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP153P49790 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NUP153P49790 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NUP153P49790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NUP153P49790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NUP153P49790 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NUP153P49790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NUP153P49790 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NUP153P49790 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NUP153P49790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NUP153P49790 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NUP153P49790 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NUP153P49790 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NUP153P49790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NUP153P49790 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NUP153P49790 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NUP153P49790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUP153P49790 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms