Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTBP49356 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTBP49356 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTBP49356 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTBP49356 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTBP49356 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTBP49356 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTBP49356 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTBP49356 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTBP49356 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNTBP49356 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNTBP49356 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNTBP49356 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTBP49356 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNTBP49356 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms