Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQLP46063 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RECQLP46063 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RECQLP46063 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RECQLP46063 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RECQLP46063 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RECQLP46063 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RECQLP46063 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RECQLP46063 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms