Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 FHN1YGR131W 525 nt5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 GRS1YBR121C 2004 nt5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 APJ1YNL077W 1587 nt5.46□□□□□ -1.53
SHQ1P40486 RRN3YKL125W 1884 nt5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 STE7YDL159W 1548 nt5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 DBF4YDR052C 2115 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 AIM17YHL021C 1398 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 MHF2YDL160C-A 243 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 RRP45YDR280W 918 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 RPL28YGL103W 450 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 RPB4YJL140W 666 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 MET31YPL038W 534 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YOR1YGR281W 4434 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YNL247WYNL247W 2304 nt5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 SLC1YDL052C 912 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 TRS23YDR246W 660 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YML131WYML131W 1098 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 PEX32YBR168W 1242 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 ROT2YBR229C 2865 nt5.44□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 PAL1YDR348C 1500 nt5.43□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 QCR2YPR191W 1107 nt5.43□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 SIP5YMR140W 1470 nt5.43□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 ELP2YGR200C 2367 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 VAN1YML115C 1608 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YMR245WYMR245W 621 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YNL165WYNL165W 1221 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 RAD53YPL153C 2466 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 CTS2YDR371W 1536 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 MSS116YDR194C 1995 nt5.42□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 BUD14YAR014C 2130 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 ADE3YGR204W 2841 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 MSH1YHR120W 2880 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 IWR1YDL115C 1062 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 ORM1YGR038W 669 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YMR010WYMR010W 1218 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YNR042WYNR042W 429 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 ENV9YOR246C 993 nt5.41□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 THI5YFL058W 1023 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 PHO86YJL117W 936 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 FUN19YAL034C 1242 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 YNL296WYNL296W 315 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 THI12YNL332W 1023 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 BUB3YOR026W 1026 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 snR32snR32 188 nt5.4□□□□□ -1.54
SHQ1P40486 SPC97YHR172W 2472 nt5.39□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YDR134CYDR134C 411 nt5.39□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 TLG2YOL018C 1194 nt5.39□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 NOP7YGR103W 1818 nt5.39□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 GLT1YDL171C 6438 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 UBP9YER098W 2265 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YDR417CYDR417C 372 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 LCP5YER127W 1074 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 SER1YOR184W 1188 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 ECM7YLR443W 1347 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 ACS2YLR153C 2052 nt5.38□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PWP1YLR196W 1731 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 DAL81YIR023W 2913 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PHM8YER037W 966 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YJU2YKL095W 837 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 BUD28YLR062C 378 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 MRPL4YLR439W 960 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PDR16YNL231C 1056 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 NRM1YNR009W 750 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PPG1YNR032W 1107 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 MRL1YPR079W 1146 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 UBX7YBR273C 1311 nt5.37□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 JEM1YJL073W 1938 nt5.36□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 RIM15YFL033C 5313 nt5.36□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 TRX2YGR209C 315 nt5.36□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 CTR2YHR175W 570 nt5.36□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PRE7YBL041W 726 nt5.36□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YJL206CYJL206C 2277 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 TUL1YKL034W 2277 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 OCA5YHL029C 2040 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 AUA1YFL010W-A 285 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PDE1YGL248W 1110 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YNL019CYNL019C 855 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YNL033WYNL033W 855 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 ZPS1YOL154W 750 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 DNF2YDR093W 4839 nt5.35□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PAP1YKR002W 1707 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 RCK1YGL158W 1539 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 BGL2YGR282C 942 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 YKL107WYKL107W 930 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 CKB2YOR039W 777 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 snR17bsnR17b 332 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 CDC28YBR160W 897 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 PHO90YJL198W 2646 nt5.34□□□□□ -1.55
SHQ1P40486 TUB2YFL037W 1374 nt5.33□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YNL095CYNL095C 1929 nt5.33□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.33□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.33□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 HXT4YHR092C 1731 nt5.33□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 GCN20YFR009W 2259 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 MNN10YDR245W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 FAU1YER183C 636 nt5.32□□□□□ -1.56
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