Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 MED2YDL005C 1296 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YDL241WYDL241W 372 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SLO1YER180C-A 258 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 HSP12YFL014W 330 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SPO12YHR152W 522 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 VTA1YLR181C 993 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PIN2YOR104W 849 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 ARG81YML099C 2643 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 LSG1YGL099W 1923 nt5.35□□□□□ -1.55
LTP1P40347 MET3YJR010W 1536 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RQC1YDR333C 2172 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 COX26YDR119W-A 201 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YDR161WYDR161W 1164 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 CAD1YDR423C 1230 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 ATP12YJL180C 978 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RMI1YPL024W 726 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PRM4YPL156C 855 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SAM4YPL273W 978 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SUE1YPR151C 621 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 NDC1YML031W 1968 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YML082WYML082W 1950 nt5.34□□□□□ -1.55
LTP1P40347 MMP1YLL061W 1752 nt5.34□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SOG2YOR353C 2376 nt5.34□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RTN1YDR233C 888 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 ATO3YDR384C 828 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RPT6YGL048C 1218 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 CAB4YGR277C 918 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YHL044WYHL044W 708 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 CIS3YJL158C 684 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 BAG7YOR134W 1230 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YOR318CYOR318C 306 nt5.33□□□□□ -1.56
LTP1P40347 MCM4YPR019W 2802 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 MRPL1YDR116C 858 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 UBC6YER100W 753 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 HAP2YGL237C 798 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 CTR3YLR411W 726 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 PCL1YNL289W 840 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 CSG2YBR036C 1233 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 OAZ1YPL052W 879 nt5.32□□□□□ -1.56
LTP1P40347 IFM1YOL023W 2031 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 ARN2YHL047C 1863 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YGL036WYGL036W 2730 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 GET3YDL100C 1065 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 PCL6YER059W 1263 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YGR011WYGR011W 327 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 COS9YKL219W 1224 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 AFT1YGL071W 2073 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 IBA57YJR122W 1494 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SKI2YLR398C 3864 nt5.31□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YIL067CYIL067C 2037 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 GCV1YDR019C 1203 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 PRO3YER023W 861 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 NPA3YJR072C 1158 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RPC19YNL113W 429 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YNL296WYNL296W 315 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RPN7YPR108W 1290 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 IFA38YBR159W 1044 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RTG3YBL103C 1461 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 ECM3YOR092W 1842 nt5.3□□□□□ -1.56
LTP1P40347 TRP4YDR354W 1143 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SEC20YDR498C 1152 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RME1YGR044C 903 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YIL028WYIL028W 399 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 RRN10YBL025W 438 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 MRPS8YMR158W 468 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 BBP1YPL255W 1158 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SMF3YLR034C 1422 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 WTM2YOR229W 1404 nt5.29□□□□□ -1.56
LTP1P40347 MAD3YJL013C 1548 nt5.28□□□□□ -1.56
LTP1P40347 CLD1YGR110W 1338 nt5.28□□□□□ -1.56
LTP1P40347 SNM1YDR478W 597 nt5.28□□□□□ -1.56
LTP1P40347 HAT2YEL056W 1206 nt5.28□□□□□ -1.56
LTP1P40347 YER010CYER010C 705 nt5.28□□□□□ -1.56
LTP1P40347 IPI1YHR085W 1005 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms