Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK1P39086 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK1P39086 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms