Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 YOR318CYOR318C 306 nt5.57□□□□□ -1.52
SPT8P38915 YPL062WYPL062W 405 nt5.57□□□□□ -1.52
SPT8P38915 PAL1YDR348C 1500 nt5.57□□□□□ -1.52
SPT8P38915 PMT2YAL023C 2280 nt5.57□□□□□ -1.52
SPT8P38915 ARP2YDL029W 1176 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 SCM3YDL139C 672 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 MRPL13YKR006C 795 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 PPG1YNR032W 1107 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 ETR1YBR026C 1143 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 BRE2YLR015W 1518 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 HOF1YMR032W 2010 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 KCH1YJR054W 1494 nt5.56□□□□□ -1.52
SPT8P38915 YLH47YPR125W 1365 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 APJ1YNL077W 1587 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 RAD53YPL153C 2466 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 DBF2YGR092W 1719 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 URA7YBL039C 1740 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 GET3YDL100C 1065 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 PUS5YLR165C 765 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 ETT1YOR051C 1239 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 RPL3YOR063W 1164 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 SED4YCR067C 3198 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 THI21YPL258C 1656 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 UGA1YGR019W 1416 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 MGS1YNL218W 1764 nt5.55□□□□□ -1.52
SPT8P38915 IWR1YDL115C 1062 nt5.54□□□□□ -1.52
SPT8P38915 RPL28YGL103W 450 nt5.54□□□□□ -1.52
SPT8P38915 MRI1YPR118W 1236 nt5.54□□□□□ -1.52
SPT8P38915 YGL036WYGL036W 2730 nt5.54□□□□□ -1.52
SPT8P38915 MPP10YJR002W 1782 nt5.54□□□□□ -1.52
SPT8P38915 STE7YDL159W 1548 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 YAP1YML007W 1953 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 AAD4YDL243C 990 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 SFK1YKL051W 1062 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 SAM4YPL273W 978 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 NOB1YOR056C 1380 nt5.53□□□□□ -1.52
SPT8P38915 ACS2YLR153C 2052 nt5.52□□□□□ -1.53
SPT8P38915 MLC1YGL106W 450 nt5.52□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YGR182CYGR182C 354 nt5.52□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.52□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.52□□□□□ -1.53
SPT8P38915 RSC6YCR052W 1452 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 BLM10YFL007W 6432 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 WTM2YOR229W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 ADK2YER170W 678 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 RPB4YJL140W 666 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 SCW10YMR305C 1170 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 CAR1YPL111W 1002 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 APE1YKL103C 1545 nt5.51□□□□□ -1.53
SPT8P38915 ADE3YGR204W 2841 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 CDC4YFL009W 2340 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YDR134CYDR134C 411 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 PRO3YER023W 861 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YGL185CYGL185C 1140 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 MET31YPL038W 534 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 FUI1YBL042C 1920 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YNL095CYNL095C 1929 nt5.5□□□□□ -1.53
SPT8P38915 KNH1YDL049C 807 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 TRS23YDR246W 660 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 BBP1YPL255W 1158 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 TPS3YMR261C 3165 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YEF1YEL041W 1488 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 MCX1YBR227C 1563 nt5.49□□□□□ -1.53
SPT8P38915 ZUO1YGR285C 1302 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 FHL1YPR104C 2811 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 TEA1YOR337W 2280 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 MHF2YDL160C-A 243 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 SNF11YDR073W 510 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 SKI6YGR195W 741 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 DBP8YHR169W 1296 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 RDL1YOR285W 420 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 PDR10YOR328W 4695 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 HXT14YNL318C 1623 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 CYK3YDL117W 2658 nt5.48□□□□□ -1.53
SPT8P38915 SNF3YDL194W 2655 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 ELP2YGR200C 2367 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 RSM10YDR041W 612 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 ASP1YDR321W 1146 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 YLR346CYLR346C 306 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 SOL1YNR034W 966 nt5.47□□□□□ -1.53
SPT8P38915 PWP1YLR196W 1731 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 DAL3YIR032C 588 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YJR085CYJR085C 318 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 FUN19YAL034C 1242 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 ECM33YBR078W 1290 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 QCR2YPR191W 1107 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 NTH2YBR001C 2343 nt5.46□□□□□ -1.54
SPT8P38915 AFT1YGL071W 2073 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 MHR1YDR296W 681 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 GRX4YER174C 735 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YNL019CYNL019C 855 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YNL033WYNL033W 855 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 NOT3YIL038C 2511 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 CNM67YNL225C 1746 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 ROT2YBR229C 2865 nt5.45□□□□□ -1.54
SPT8P38915 GIP1YBR045C 1920 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 SLC1YDL052C 912 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 AUA1YFL010W-A 285 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms