Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MARCKSP29966 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms