Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD1CP29017 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD1CP29017 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1CP29017 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1CP29017 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1CP29017 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1CP29017 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1CP29017 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD1CP29017 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD1CP29017 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1CP29017 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1CP29017 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1CP29017 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1CP29017 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1CP29017 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1CP29017 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1CP29017 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD1CP29017 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD1CP29017 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD1CP29017 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1CP29017 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD1CP29017 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD1CP29017 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1CP29017 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms