Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2AP28223 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTR2AP28223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTR2AP28223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms