Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD27P26842 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD27P26842 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD27P26842 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD27P26842 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD27P26842 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD27P26842 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD27P26842 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD27P26842 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD27P26842 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD27P26842 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD27P26842 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD27P26842 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD27P26842 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD27P26842 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD27P26842 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD27P26842 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD27P26842 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD27P26842 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD27P26842 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD27P26842 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD27P26842 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD27P26842 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD27P26842 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms