Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
YY1P25490 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
YY1P25490 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
YY1P25490 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
YY1P25490 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
YY1P25490 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
YY1P25490 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
YY1P25490 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
YY1P25490 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
YY1P25490 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
YY1P25490 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
YY1P25490 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
YY1P25490 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
YY1P25490 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
YY1P25490 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YY1P25490 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YY1P25490 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YY1P25490 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YY1P25490 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YY1P25490 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YY1P25490 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YY1P25490 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
YY1P25490 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YY1P25490 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YY1P25490 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YY1P25490 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YY1P25490 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
YY1P25490 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YY1P25490 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YY1P25490 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms