Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP3P21580 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP3P21580 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP3P21580 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms