Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATF3P18847 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATF3P18847 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATF3P18847 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATF3P18847 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATF3P18847 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF3P18847 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATF3P18847 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATF3P18847 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATF3P18847 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATF3P18847 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATF3P18847 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATF3P18847 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATF3P18847 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATF3P18847 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATF3P18847 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATF3P18847 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATF3P18847 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATF3P18847 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATF3P18847 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATF3P18847 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATF3P18847 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATF3P18847 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATF3P18847 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATF3P18847 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATF3P18847 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATF3P18847 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATF3P18847 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATF3P18847 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATF3P18847 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATF3P18847 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms