Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB5P18084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB5P18084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms