Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP1P11387 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1P11387 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1P11387 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1P11387 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1P11387 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1P11387 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1P11387 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1P11387 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1P11387 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1P11387 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1P11387 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1P11387 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1P11387 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1P11387 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1P11387 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1P11387 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1P11387 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms