Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA1P0DJI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA1P0DJI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms