Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRBP09619 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRBP09619 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRBP09619 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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