Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRCP08575 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
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