Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGAP02671 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGAP02671 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGAP02671 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGAP02671 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGAP02671 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGAP02671 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGAP02671 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGAP02671 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGAP02671 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGAP02671 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGAP02671 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGAP02671 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGAP02671 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGAP02671 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGAP02671 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGAP02671 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGAP02671 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGAP02671 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGAP02671 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGAP02671 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGAP02671 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGAP02671 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGAP02671 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGAP02671 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGAP02671 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms