Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFP01133 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFP01133 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFP01133 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFP01133 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EGFP01133 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGFP01133 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFP01133 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFP01133 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFP01133 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFP01133 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EGFP01133 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGFP01133 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFP01133 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFP01133 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EGFP01133 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EGFP01133 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFP01133 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFP01133 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFP01133 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFP01133 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms