Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP4O95707 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POP4O95707 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP4O95707 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP4O95707 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POP4O95707 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POP4O95707 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POP4O95707 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP4O95707 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP4O95707 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP4O95707 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP4O95707 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP4O95707 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP4O95707 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP4O95707 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP4O95707 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP4O95707 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP4O95707 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP4O95707 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP4O95707 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POP4O95707 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms