Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR4O95473 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms