Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB11O95342 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ABCB11O95342 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB11O95342 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms