Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSDE1O75534 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSDE1O75534 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms