Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BANF1O75531 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BANF1O75531 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BANF1O75531 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BANF1O75531 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF1O75531 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF1O75531 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF1O75531 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF1O75531 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BANF1O75531 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BANF1O75531 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BANF1O75531 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BANF1O75531 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BANF1O75531 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BANF1O75531 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BANF1O75531 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BANF1O75531 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BANF1O75531 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms