Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP3O75074 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP3O75074 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP3O75074 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP3O75074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP3O75074 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP3O75074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP3O75074 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP3O75074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP3O75074 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms