Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBNO60934 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBNO60934 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBNO60934 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBNO60934 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBNO60934 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBNO60934 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBNO60934 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NBNO60934 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBNO60934 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBNO60934 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBNO60934 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBNO60934 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBNO60934 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBNO60934 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBNO60934 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBNO60934 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBNO60934 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBNO60934 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBNO60934 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBNO60934 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBNO60934 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBNO60934 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBNO60934 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms