Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms