Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF9O60383 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF9O60383 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF9O60383 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF9O60383 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF9O60383 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF9O60383 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF9O60383 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF9O60383 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF9O60383 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF9O60383 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF9O60383 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF9O60383 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF9O60383 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF9O60383 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF9O60383 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF9O60383 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF9O60383 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF9O60383 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF9O60383 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF9O60383 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF9O60383 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF9O60383 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF9O60383 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms