Protein–RNA interactions for Protein: O60353

FZD6, Frizzled-6, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD6O60353 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD6O60353 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD6O60353 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD6O60353 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD6O60353 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD6O60353 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD6O60353 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD6O60353 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD6O60353 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD6O60353 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD6O60353 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD6O60353 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD6O60353 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD6O60353 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD6O60353 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms