Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LANCL1O43813 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms