Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SNAP23O00161 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP23O00161 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP23O00161 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms