Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KRW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KRW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3KRW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3KRW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3KRW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3KRW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3KRW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KRW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KRW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KRW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KRW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3KRW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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