Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHLA1C9JL84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms