Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGPD3A6NKT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms