Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM200CA6NKL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms