Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC10BA6NIK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms