Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT1A5YKK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms