Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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